IBS, 초고해상도 형광현미경법 개발···'민물장어 형광단백질' 활용

IBS 심상희 박사 연구팀이 민물장어의 형광단백질로 살아있는 세포내 구조를 8배 더 오래 관찰할 수 있는 초고해상도 형광현미경법을 개발했다. 사진은 살아있는 세포 내 미토콘드리아의 2색 초고해상도 동영상.<사진= IBS>
IBS 심상희 박사 연구팀이 민물장어의 형광단백질로 살아있는 세포내 구조를 8배 더 오래 관찰할 수 있는 초고해상도 형광현미경법을 개발했다. 사진은 살아있는 세포 내 미토콘드리아의 2색 초고해상도 동영상.<사진= IBS>
IBS(기초과학연구원)는 심상희 분자분광학·동력학연구단 연구팀이 서울대·UNIST(울산과학기술원)와 공동 연구를 통해 민물장어의 형광단백질로 살아 있는 세포 내 구조를 8배 더 오래 관찰할 수 있는 초고해상도 형광현미경법을 개발했다고 4일 밝혔다. 

세포는 생체 기본단위다. 수 나노미터 크기의 다양한 분자들이 역동적으로 변화하는 복잡계다. 살아 있는 세포 속 나노 구조를 관찰하기 위해선 초고해상도 형광현미경이 필요하다. 하지만 형광 단백질이 반복적으로 빛에 노출되면 형광이 사라지는 '광표백 현상'으로 인해 장시간 초해상도 촬영이 어렵다는 한계가 있었다.

형광단백질은 대부분 단백질 자체의 아미노산을 발광체로 사용한다. 이 때문에 오랫동안 빛에 노출되면 단백질의 구조가 손상되고, 형광 발광도 사라진다. 기존 기술로 형광 동영상을 오랫동안 촬영하면 점차 형광신호 세기가 약해지다가 결국 사라지게 된다.

IBS 연구진은 민물장어에서 유래한 형광단백질인 우나지가 내부 아미노산이 아닌 외부 대사물질인 빌리루빈(헤모글로빈 분해로 생성되는 치자색 색소)을 발광체로 사용한다는 점에 착안해 장시간 살아있는 세포를 관찰할 수 있는 현미경법을 고안해냈다. 

우나지 단백질과 빌리루빈은 각각 떨어져 있을 때 형광을 발광하지 못하는 물질이지만, 결합하면 밝은 녹색 형광을 내는 형광물질이 된다.

연구진은 우나지-빌리루빈 결합체에 청색광을 쪼이면 광표백에 의해 형광이 꺼지고, 이후 다시 빌리루빈을 처리하면 형광이 되살아난다는 사실을 규명했다. 청색광과 빌리루빈 용액을 이용해 형광 신호를 끄고 켤 수 있다는 의미다. 광표백 이후에도 우나지 단백질 자체에 구조적 손상이 일어나지 않는다.

UnaG 단백질의 광표백-형광회복 순환 사이클.<사진= IBS>
UnaG 단백질의 광표백-형광회복 순환 사이클.<사진= IBS>
빌리루빈 수용액 상에서 우나지 단백질은 손상된 빌리루빈과의 분리 및 새로운 빌리루빈과의 결합을 반복한다. 이 때문에 광표백-형광회복 과정이 순환되며 반복적으로 형광 스위칭 반응을 일으킬 수 있다.

이후 연구진은 우나지를 초고해상도 형광현미경에 적용했다. 세포 내 구조에 우나지를 표지하고 청색광을 쪼여 형광을 끈 뒤, 빌리루빈과의 재결합을 통해 일부 우나지만 형광이 켜지도록 조절했다. 이를 통해 세포 속 분자들의 위치를 나노미터 수준의 정확도로 측정해 초고해상도 이미지를 구성할 수 있었다. 

우나지는 기존 형광 단백질에 비해 크기가 절반 수준으로 분자들의 위치를 고밀도로 표지할 수 있어 해상도를 높일 수 있다는 장점도 있다. 더 나아가 연구진은 레이저 세기와 용액 내 산소 농도를 통해 형광이 꺼지고 회복하는 반응 속도를 조절하는데도 성공했다.
 
이번 연구는 형광 스위칭을 적절한 속도로 지속적으로 반복할 수 있는 관찰 기법을 개발한 것으로, 살아있는 세포에서 광표백에 제한받지 않는 초고해상도 동영상 촬영이 가능해졌다는 의미가 있다. 기존 기술에 비해 약 8배 오래 세포를 관찰할 수 있어 세포 내부 구조를 더 정확히 파악할 수 있다.

심상희 교수는 "초고해상도 형광현미경으로 살아있는 세포의 동영상을 촬영하는 데 걸림돌이 되어왔던 광표백 한계를 극복한 기술"이라며 "이 기술이 향후 장시간 관찰이 필요한 생체 나노구조 파악 및 생명현상 연구의 발전에 크게 기여할 것으로 기대한다"고 말했다. 

연구결과는 국제학술지 네이처 커뮤니케이션즈(Nature Communication) 1월 14일자 온라인 판에 게재됐다. 

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