교협은 이날 "경찰 수사 관련 중간자료에 사실과 다른 부분이 매우 많다"며 "학교 측 역시 경찰 수사결과를 확대·해석해 발표하고, 언론에 왜곡된 진실을 퍼뜨리고 있다"고 주장했다. 경종민 교협 회장은 "고소의 증거자료라는 전화 메모는 조작됐을 가능성이 크다"며 "정확히 말을 하긴 힘들지만, 특허를 원발명자의 이름으로 돌려놓는 과정에서 문제가 될 수 있는 부분을 없애기 위해 이후에 쓰여진 것으로 보인다"고 밝혔다.

또 그는 "학교 측이 언론에 배포한 '경찰 수사상황 보충 설명자료'는 고소인의 고발내용을 담은 것 뿐"이라면서 "경찰의 수사결과를 학교에서 확대 해석한 것"이라고 강조하기도 했다. '맞고소'는 왜 하지 않았느냐는 질문에 경 회장은 "학교 측과 싸우면서 이전투구하는 모습을 보이고 싶진 않다"며 "다음달 이사회가 열리기 전까지 이런 상황이 계속된다면 모든 방법을 동원할 계획"이라고 말했다.

이러한 교협의 주장에 KAIST 측은 경찰의 수사상황 결과자료를 근거로 설명회를 가졌고, 경찰의 수사 결과를 확대 해석해 발표한 적도 없다는 입장을 밝혔다.

KAIST 관계자는 "최종적인 검찰의 수사결과가 나오지도 않은 상황에서 학교본부의 공식적인 입장을 밝히는 것은 적절하지 않다"면서도 "다만 검찰수사를 통해 교협 운영위가 학교본부와 서 총장 개인에 대한 명예를 훼손한 부분에 대해서는 실체적 진실이 명확하게 밝혀지길 기대한다"고 밝혔다.