정부출연연구원들의 과도한 연구과제 수행 문제가 도마 위에 올랐다. 연구원 1명이 무려 32개 과제에 참여하고 있는 사례도 알려져 다시 한 번 출연연의 연구환경 개선이 시급하다는 주장이 국감장에서 제기됐다. 

민병주 새누리당 의원이 국가과학기술연구회로 부터 제출받은 자료에 따르면 출연연 25개 기관 중 연구원 1인당 가장 많은 과제를 동시에 수행하고 있는 연구소는 한국기계연구원으로 1인당 8.1개의 연구과제를 수행하고 있었다. 다음으로 세계김치연구소의 1인당 과제수가 6.7개, 재료연구원이 1인당 6.6개인 것으로 조사됐다.

민 의원은 "과학계에서는 연구원 1인당 적절하게 담당할 수 있는 과제수를 1개 내지 2개 정도로 보고, 과제 1개당 연간 4번 정도의 진도보고와 중간보고서 등을 제출해야 하기 때문에 과제수가 3개를 넘어가면 매달 보고서를 작성하느라 실질적인 연구를 할 수 없다"며 "국과과학기술연구회 소관 연구소는 개인당 4.9건으로 너무 과도하다"고 지적했다.

민 의원은 "연구에 있어서 상상력과 창의력이 중시되고 있는 시점에서, 연구원들의 연구과제 수주는 모든 출연연들이 공통으로 가지고 있는 애로사항"이라며 "연구원이 진정한 연구에 몰입할 수 있는 환경을 조성해야 한다"고 강조했다. 

한편 기계연 관계자는 "32개 과제 수행은 실제 연구과제를 직접 참여하는게 아니고 시험조사 데이터 확인 등 1~2% 수준의 참여 과제를 총망라해 집계된 것"이라며 "연구원당 과제 수행수준이 타 연구소에 비해 높긴 하지만 기계연은 민간수탁 과제 수행 비중이 높아 전반적으로 연구과제 수가 많아진 것"이라고 해명했다. 

과학기술계 한 인사는 "PBS체제에 여전히 못벗어나고 있는 현재 출연연의 운영시스템을 총체적으로 혁신해야 한다"며 "국가적 연구를 위한 출연연의 고유 미션을 하루 빨리 정립해 중대형 연구과제 중심으로 연구자원이 집결되도록 체제 개편이 필요하다"고 말했다.