또 '서 총장이 해당 교수에게 특허를 되돌려 주고, 직접 사과를 했다'는 허위사실 유포와 언론사에 제보해 KAIST와 서 총장의 명예를 훼손했다는 부분에 대해서는 증거 불충분을 이유로 불기소 의견을 달아 사건을 검찰에 송치했다고 덧붙였다.

학교 측은 이 같은 중간 수사 결과에 "사실 관계가 명확히 밝혀졌다"며 "명예훼손 부분에 대해서는 학교 측에서 확보한 자료가 있으며, 진실을 규명하기 위해 향후 진행되는 검찰 수사에 적극적으로 협조할 생각"이라고 말했다.

그러나 교수협의회 측은 특정 언론사에서 직접 제보 및 기사화를 위한 취재를 요구했지만, 자신들은 '서남표 총장이 해당 교수에 직접 사과를 했다'는 내용으로 제보를 하지 않았다고 주장했다. 이에 따라 허위사실 유포자인 '성명불상자'에 대한 수사가 검찰의 향후 조사 방향의 핵심이 될 것으로 보인다.

이 변호사는 "허위 사실을 유포해 서 총장의 명예와 학교의 명예가 떨어졌다"며 "이 같은 사실을 제보한 사람이 누구인지, 유포 배경을 밝히는 과정에 협조를 다할 것"이라고 말했다. 특허 논란의 중심에 서 있는 해당 교수는 억울하다는 입장이다.

그는 "경찰에 모든 것을 말했다. 특허 명의 변경을 위해 전화를 했다는 것은 말도 안 되는 소리"라며 "증거가 불충분한데도 결과가 이렇게 나왔다. 그날 전화를 하지 못하는 상황을 객관적 자료로 입증을 했지만 경찰 수사 결과는 다르게 나온 것 같다"고 밝혔다.

이 교수는 "누군가 전화했다는 건 사실인 것 같다. 우리의 주장은 총장이 주도해서 특허를 도둑질 했다는 게 아니다. 누가 전화를 해서 특허 명의를 바꿨느냐다"며 "총장이 주도해서 특허를 가져갔다고 생각하고 싶진 않다. 검찰 수사에 적극적으로 협조할 생각"이라고 덧붙였다. 한편 KAIST는 지난 3월 8일 서남표 총장의 특허 가로채기 의혹을 제기한 교수협의회 관계자 등 4명을 상대로 명예훼손, 문서위조 등 혐의로 경찰에 고소했다.